Só é possível deixar Mercado Pago como app padrão pelo aplicativo

Acesse o aplicativo do Mercado Pago e vá em "Aproxime o celular e pague". Em seguida, toque em "Autorize o Mercado Pago para aproximar e pagar" para colocar o app como padrão. 

Para pagar por aproximação com app do Mercado Pago, é necessário ter celular Android 6 ou mais recente e com tecnologia NFC.